Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms