Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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PGGT1BP53609 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP53609 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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