Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 IGKV2OR2-7D-201ENST00000603664 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HOXA5P20719 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms