Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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PTPRAP18433 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
PTPRAP18433 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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