Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Top3bQ9Z321 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top3bQ9Z321 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms