Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z139

Ror1, Inactive tyrosine-protein kinase transmembrane receptor ROR1, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ror1Q9Z139 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ror1Q9Z139 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms