Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx1Q9WV80 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms