Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sema6cQ9WTM3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sema6cQ9WTM3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms