Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Psmb3Q9R1P1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Psmb3Q9R1P1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms