Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Psma4Q9R1P0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Psma4Q9R1P0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms