Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed2Q9R0Q3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed2Q9R0Q3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms