Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rnf4Q9QZS2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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