Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcf1Q9QZM3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcf1Q9QZM3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clcf1Q9QZM3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clcf1Q9QZM3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clcf1Q9QZM3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clcf1Q9QZM3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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