Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndrg3Q9QYF9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndrg3Q9QYF9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndrg3Q9QYF9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndrg3Q9QYF9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndrg3Q9QYF9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndrg3Q9QYF9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndrg3Q9QYF9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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