Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nufip1Q9QXX8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms