Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms