Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkl2Q9QUK0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms