Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pgpep1Q9ESW8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms