Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slco1c1Q9ERB5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slco1c1Q9ERB5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms