Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp5oQ9DB20 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5oQ9DB20 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms