Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Jam3Q9D8B7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Jam3Q9D8B7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Jam3Q9D8B7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Jam3Q9D8B7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Jam3Q9D8B7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Jam3Q9D8B7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Jam3Q9D8B7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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