Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fip1l1Q9D824 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fip1l1Q9D824 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms