Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krt34Q9D646 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms