Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Katnal2Q9D3R6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Katnal2Q9D3R6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms