Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krt20Q9D312 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Krt20Q9D312 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms