Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS3

Fopnl, LisH domain-containing protein FOPNL, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FopnlQ9CZS3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FopnlQ9CZS3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FopnlQ9CZS3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms