Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rprd1bQ9CSU0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rprd1bQ9CSU0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms