Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc43Q9CR29 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc43Q9CR29 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms