Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tma16Q9CR02 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tma16Q9CR02 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms