Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms