Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rab5aQ9CQD1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rab5aQ9CQD1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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