Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gins4Q99LZ3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gins4Q99LZ3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms