Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PsphQ99LS3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PsphQ99LS3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms