Protein–RNA interactions for Protein: Q99L28

Rsl24d1, Probable ribosome biogenesis protein RLP24, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsl24d1Q99L28 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsl24d1Q99L28 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rsl24d1Q99L28 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms