Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dok4Q99KE3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms