Protein–RNA interactions for Protein: Q99JL1

Spef1, Sperm flagellar protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef1Q99JL1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Spef1Q99JL1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Spef1Q99JL1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Spef1Q99JL1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms