Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nrif1Q923B3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nrif1Q923B3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms