Protein–RNA interactions for Protein: Q920A0

Optc, Opticin, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptcQ920A0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
OptcQ920A0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OptcQ920A0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms