Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx15Q91WE1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx15Q91WE1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms