Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ttc8Q8VD72 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc8Q8VD72 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms