Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpm8Q8R4D5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpm8Q8R4D5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpm8Q8R4D5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpm8Q8R4D5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpm8Q8R4D5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpm8Q8R4D5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trpm8Q8R4D5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms