Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Vrk3Q8K3G5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Vrk3Q8K3G5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Vrk3Q8K3G5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vrk3Q8K3G5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vrk3Q8K3G5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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