Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LgsnQ8CIX8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LgsnQ8CIX8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms