Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc87Q8CDL9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc87Q8CDL9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms