Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CntrobQ8CB62 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms