Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Apoa5Q8C7G5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Apoa5Q8C7G5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms