Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7cQ8C6E1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7cQ8C6E1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7cQ8C6E1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7cQ8C6E1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7cQ8C6E1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apol7cQ8C6E1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apol7cQ8C6E1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms