Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FarsaQ8C0C7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FarsaQ8C0C7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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