Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Efemp1Q8BPB5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Efemp1Q8BPB5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms