Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sh3bgrl2Q8BG73 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Sh3bgrl2Q8BG73 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms